Отделение ультразвуковой диагностики организовано 5 мая 1987 года. Организатором и первым заведующим был врач УЗД Илья Валентинович Борисов. На этапе становления это был кабинет УЗД, затем появились еще три кабинета, в каждом из которых выполнялся одинаковый набор и объем исследований.
На следующем этапе развития службы кабинеты отделения стали выполнять специализированные ультразвуковые исследования (УЗИ органов брюшной полости, малого таза, забрюшинного пространства, УЗИ мягких тканей и поверхностно расположенных органов, УЗИ сердечнососудистой системы, УЗИ в гинекологии и акушерстве).
С 1991 года в отделении организована манипуляционная для проведения инвазивных процедур под ультразвуковым контролем. С появлением ультразвукового сканера с блоком цветового допплеровского картирования в 1994 году активно развиваются исследования сосудистой системы. В дальнейшем спектр ультразвуковых исследований продолжает увеличиваться (УЗИ костно-мышечной системы, транспищеводная эхокардиоскопия, инвазивные манипуляции в нейрохирургии).
Проводятся диагностические пункции органов и образований брюшной полости, забрюшинного пространства, малого таза, переднего средостения, плевральных полостей, легких, головного мозга, щитовидной железы, молочных желез, суставов. Выполняются дренирования абсцессов разной локализации, включая абсцессы головного мозга, гематом, кист почек, мошонки, брюшной полости, забрюшинного пространства со склеротерапией, кист поджелудочной железы с созданием внутреннего свища между полостью кисты и полостью желудка, кист головного мозга, нефростомии, холецистостомии, холангиостомии, диагностические пункции у беременных: хорионбиопсия, плацентобиопсия, кордоцентез (забор крови из пуповины) для генетических исследований; навигационные исследования и пункции в нейрохирургии головного мозга
С 2002 года отделение УЗД имеет два подразделения. Одно распологается непосредственно в Республиканской больнице, другое, созданное для обслуживания амбулаторных пациентов, находится в здании Консультативной поликлиники (Лесной проспект, 40).
На базе амбулаторного подразделения выполняются ультразвуковые исследоваия органов брюшной полости, малого таза, забрюшинного пространства, щитовидной, паращитовидных, молочной, слюнных желез, органов мошонки, периферических сосудов, сосудов головного мозга с использованием спектрального допплера.
Врачи отделения принимают участие в работе различных научных конференций, съездах ассоциации врачей УЗД России, Европейской ассоциации врачей УЗД, обмениваются опытом работы с врачами европейских стран (рабочие командировки в Австрию, Норвегию, Финляндию).
С момента организации отделения УЗД осуществляется сотрудничество с кафедрой лучевой диагностики и лучевой терапии Петрозаводского государственного университета.